PHPはHypertext Preprocessorといわれるウェブ構築用サーバサイドプログラム(スクリプト)でJSPやASPのようにテンプレートとなるHTMLファイルにスクリプトを埋め込み動的に処理する事ができるCGIスクリプトともいえます。
HTMLページを生成する場合もテンプレートへの埋め込みなので出力されるページにはphpスクリプトが含まれるわけではありません。
例えば、オープンソースであるブログ環境構築ソフトウェアWP/WordPressは、phpで書かれ、RDBにやはりオープンソースのMySQLが採用されています。
オープンソースRDBといえばMySQLやPostgreSQLですが、phpで書かれたオープンソースソフトウェアとしてphpMyAdmin、phpPgAdminというものがあり、いずれもサーバ上に設置し、単一または複数のデータベースを一括管理し、本来のデータベースのほぼ全ての機能を各RDBコマンドを利用するくことなくウェブブラウザ上から手軽に管理できるソフトウェアです。